德国耶拿大学医院是欧洲最现代化的医院的中心， 2004年第一阶段建设落成时，有2230个房间和444张病床对外开放。第二阶段的建设紧跟其后。建造这样一所医院的总支出在4亿1千万欧元左右，有1800名雇员。每天的手术30到50台涉及6门外科学的手术，手术室时可以同时容纳100名医生和护理人员工作。

医院的现代化表现在几个方面：机器人运输系统，最现代的呼吸辅助系统，胶囊检查系统，新型重症监护室，人工智能机器人手术。医院领先科室：药理学和血液学，心脏科。