生物医学系是巴塞尔大学与巴塞尔大学医院的联合项目。它汇聚了基础科学家和临床科学家,推动我们对健康与疾病的理解,并开发开创性的疗法,惠及未被满足需求的患者生活。
赞皮耶里团队(Zampieri Lab)提供系统药理学、计算生物学和代谢调控领域的博士研究机会。该团队的使命是理解调控短期和长期代谢适应基因和化学干扰的基本机制,寻找新的非常规治疗策略,涵盖从抗菌到抗癌药物。为此,我们开发了将代谢组学中最先进的技术与数学建模结合的新方法。
工作描述
候选人将有机会利用一些前沿的实验和计算方法,包括基于约束和动力学建模、大型数据集的统计分析、高通量代谢组学、延时显微镜,以探讨如何药理学上干扰癌症代谢调控的基本机制。系里提供的资源包括小鼠设施、高端FACS、IT和显微镜设施、生命科学培训设施(用于基因表达和蛋白质组分析)等。
主要任务
使用CRISPR基因改造的癌细胞系进行体内小鼠研究
设计、执行并分析体内CRISPR合并筛查
使用实验室开发的独特框架进行高通量代谢组学剖析。
分析和解释代谢组学数据,推导可实验验证的假设
支持和准备科学报告和期刊文章
申请要求
硕士学位包括(生物)物理学、(生物)工程学、生物科学、微生物学、生物化学、系统生物学、分子生物学、生物信息学/计算生物学或相关领域
在之前的工作中获得的小鼠实验实践经验(即硕士论文)和LTK-1认证
理想的要求:
心内注射及利用生物发光成像技术监测癌细胞的经验
基础统计方法的经验
在国际研究环境中工作的动力
学习系统生物学方法、高通量方法论和编程语言(如MATLAB、R或Python)的动机
主要参考文献
Laurentz Schuhknecht, Karin Ortmayr, Jürgen Jänes, Martina Bläsi, Eleni Panoussis, Sebastian Bors, Terézia Dorčáková, Tobias Fuhrer, Pedro Beltrao, Mattia Zampieri. A human metabolic map of pharmacological perturbations reveals drug modes of action. Nature Biotechnology (2025)
Karin Ortmayr, Meret Ringwald, Laurentz Schuhknecht, Sébastien Dubuis, Eleni Paunossis, Martina Blaesi, Charly Jehanno, Sarah D Grieder, Mohamed Bentires-Alj, Moritz Mall, Mattia Zampieri. The glutamine-aspartate metabolic tradeoff between fast growth and metabolic flexibility. BioRxiv (2025)申请 / 联系方式
申请方式
请通过巴塞尔大学招聘门户提交申请:
https://career2.successfactors.eu/career?company=UNIBAS&career_ns=job_application&career_job_req_id=6683&jobPipeline=universitypositions.eu
提交以下所需材料:A)求职信,B)完整简历;C)博士申请表(见 https://www.zampierilab.org/join-us/)(D)至少两位推荐人推荐人。